Aufgewachsen in Eschwege, Nordhessen, absolvierte er das Studium der Humanmedizin in Freiburg im Breisgau. Es folgte ein Jahr als Pre-Registration House Officer in Darlington und in Torbay, UK, bevor er die Ausbildung zum Facharzt für Augenheilkunde an der Universitätsmedizin unter Prof. N. Pfeiffer durchlief. In dieser Zeit übernahm er auch die Leitung der Hornhautbank des Landes Rheinland-Pfalz in Mainz, die unter seiner Führung die Anzahl der Hornhautspenden um 600% steigern konnte. Er etablierte das moderne Hornhauttransplantationsverfahren der DMEK in Mainz und habilitierte dort zu dem Thema: “Mechanische und lasergestützte Schnittführung der Kornea – Morphologische und funktionelle Aspekte”.
Es folgten 3 Jahre als Leitender Oberarzt an der Augenklinik Marzahn, Berlin, wo er die Ausbildung zum Operateur für Kataraktchirurgie genoss. Anschließend war er weitere 8 Jahre, zuletzt als Gesellschafter, im Augen-MVZ Landshut, Bayern tätig. Seit 2024 ist Privatdozent Dr. med. Jan M. Vetter in Kassel, Bad Wilhelmshöhe niedergelassen als Facharzt für Augenheilkunde.